Projets de biologie

Trois types de travaux de biologie sont réunis ici : une expérience de PCR en classe avec un dossier complet, trois textes de recherche, et un laboratoire web interactif qui transforme la transformation par Agrobacterium en exercice de glisser-déposer. L’ordre est expérience → articles → interactif, et chaque élément ouvre son document source.

Laboratoire PCR

Pionnier de la première expérience PCR au lycée, introduisant des expériences de biologie avancées en classe.
Exploration des dosages optimaux de réactifs pour les expériences en classe grâce à des pré-expériences et des expériences de quantité de matrice.

L'électrophorèse sur gel montre des bandes claires, confirmant l'amplification réussie du gène cible.
Comparé au marqueur standard, la longueur est d'environ 600 pb, conforme aux attentes expérimentales.

Conception expérimentale

Conception expérimentale PCR détaillée incluant la conception d'amorces, les paramètres de cyclage thermique et l'optimisation du système de réaction. Pratique pour les cours de biologie au lycée, fournissant une référence pour les expériences futures.

Conception expérimentale

Rapport de laboratoire final

Enregistrements expérimentaux complets, analyse des données et conclusions validant l'efficacité de la conception expérimentale.

Rapport de laboratoire

Archives des thèses

Enregistrements de recherche et de réflexion, incluant des articles terminés et des travaux en cours.

Terminé 2024.6.23

Sur la conjecture des protéines comme matériel génétique dans des organismes extrêmement, extrêmement spéciaux

Explore la possibilité que des protéines servent de vecteurs génétiques primitifs, en partant de l’auto-réplication des prions et de la transcription inverse, et prend les limites du dogme central comme question centrale.

Question: Une protéine peut-elle servir de matériel génétique chez des organismes très particuliers, comme le font l’ADN et l’ARN ?
Méthode: Analyse théorique. Vérifie si les quatre approches classiques d’identification du matériel génétique — marquage isotopique, centrifugation, principe soustractif et séquençage — restent valables pour les rétrovirus, en s’appuyant sur les hypothèses sur l’origine des protéines et des virus.
Conclusion: Propose que la transcriptase inverse n’agit comme matériel génétique des rétrovirus qu’avec l’ARN, et suggère que les protéines ont pu jouer un rôle analogue lors du passage du non-vivant au vivant. L’auteur rappelle que la question reste débattue.

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Article sur la photosynthèse des plantes C3

Brouillon 2024.6.8

Recherche en biologie moléculaire sur le cycle de Calvin chez les plantes C3

Parcourt le cycle de Calvin, voie centrale de fixation du carbone, sous l’angle de la biologie moléculaire : la séquence réactionnelle est décomposée étape par étape, les réactions clés sont représentées sous forme de structures moléculaires, et la formation des sucres est analysée.

Question: Comment se déroule chaque étape du cycle de Calvin, et d’où vient le sucre ?
Méthode: Revue de littérature et schémas de structures moléculaires. Reconstitue l’assimilation du carbone dans l’ordre des réactions, dessine les changements de structure aux étapes clés, puis analyse la formation des sucres.
Résultat: Transforme une voie d’assimilation complexe en une séquence claire et citable pour les travaux de biologie moléculaire ultérieurs. Le manuscrit est encore en révision.

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Article sur l’expérience des boîtes oranges de Saccharomyces cerevisiae

Brouillon 2026.03.08

Analyse et vérification du changement de couleur orange des plaques dans les expériences sur la levure

Étudie pourquoi les boîtes de culture virent parfois à l’orange lors de la culture de levures, en écartant une à une les sources de coloration par des expériences à variable contrôlée, et tire de ce cas une démarche d’analyse des erreurs et de contrôle qualité au laboratoire.

Observation: Lors d’une expérience de classe, les levures ont d’abord formé des colonies blanc laiteux normales. Quelque temps plus tard, les colonies ont été recouvertes d’orange jusqu’à ce que toute la boîte vire à l’orange.
Méthode: Analyse puis écarte quatre causes possibles (changement des conditions de croissance, mutation, métabolites et exsudats, contamination par d’autres micro-organismes), puis conçoit des expériences à variable contrôlée : changement de souche, lots de dilution séparés, grand erlenmeyer contre petit bécher, boîte scellée ou non, ensemencement par stries contre étalement.
État: La coloration par les métabolites de la levure elle-même est écartée — concentrations trop faibles et complexation insuffisante pour colorer toute une boîte. La piste de la contamination est encore à l’étude et le manuscrit reste inachevé.

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Schéma de la transformation par Agrobacterium

Explorer les processus biologiques grâce au développement interactif

Transformer des flux de génie génétique complexes en interactions web intuitives, rendant l'apprentissage vivant et engageant. L'application web de transformation par Agrobacterium démontre comment construire des outils d'enseignement de la biologie avec du code.

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